Koniec działalności Specjalnych Stref Ekonomicznych a rozliczenie zwolnienia z podatku dochodowego w 2026 roku

W interpretacji indywidualnej z dnia 21 października 2025 r., Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej (DKIS) odniósł się do kluczowej kwestii, która dotknie wielu przedsiębiorców prowadzących działalność na podstawie uzyskanego Zezwolenia strefowego. Interpretacja dotyczyła kwestii ostatniego roku podatkowego, w którym można skorzystać ze zwolnienia na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych (CIT).

W opisie stanu faktycznego Spółka, będąca dużym przedsiębiorcą, wskazała, że prowadzi działalność produkcyjną na terenie Specjalnej Strefy Ekonomicznej (SSE) na podstawie zezwolenia wydanego w 2016 r.

Podatnik zapytał, czy zachowa prawo do objęcia zwolnieniem podatkowym na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy CIT dochodu uzyskanego z działalności prowadzonej na terenie SSE od 1 stycznia 2026 r. do 31 grudnia 2026 r., w sytuacji gdy deklaracja CIT za rok podatkowy obejmujący ten okres zostanie złożona po tej dacie, tj. w 2027 r.

Spółka wskazała, że prawo do zwolnienia podatkowego powinno być uzależnione od momentu uzyskania dochodu w okresie obowiązywania zezwolenia i funkcjonowania SSE, a nie od daty złożenia deklaracji podatkowej. Zdaniem podatnika, dochód wygenerowany do 31 grudnia 2026 r. powinien podlegać zwolnieniu, nawet jeśli zostanie wykazany w deklaracji złożonej w 2027 r.

DKIS potwierdził prawidłowość stanowiska podatnika. Wskazano, że przepisy nie uzależniają prawa do zwolnienia z opodatkowania od momentu złożenia deklaracji podatkowej. Kluczowe jest, aby dochód został uzyskany w okresie obowiązywania zezwolenia i funkcjonowania SSE, tj. do 31 grudnia 2026 r. Dochód ten może być wykazany w deklaracji CIT składanej po tej dacie.

Komentarz PwC

W ostatnim czasie wśród przedsiębiorców prowadzących działalność na terenie Specjalnych Stref Ekonomicznych pojawiły się wątpliwości dotyczące rozliczenia dochodu za 2026 rok, czyli ostatniego roku funkcjonowania SSE. Najczęściej pytania dotyczą tego, czy możliwe i bezpieczne jest skorzystanie ze zwolnienia z podatku dochodowego w odniesieniu do dochodów uzyskanych od 1 stycznia do 31 grudnia 2026 r., w sytuacji, gdy deklaracja CIT za ten okres zostanie złożona już po zakończeniu funkcjonowania SSE, czyli w 2027 roku.

Interpretacja indywidualna wydana przez Dyrektora Krajowej Informacji Skarbowej z 21 października 2025 r. jednoznacznie potwierdza, że prawo do zwolnienia podatkowego przysługuje w odniesieniu do dochodu uzyskanego w całym 2026 roku, niezależnie od terminu złożenia deklaracji podatkowej. Kluczowe znaczenie ma fakt, że decydujący jest moment uzyskania dochodu w okresie obowiązywania zezwolenia i funkcjonowania strefy, a nie data wykazania tego dochodu w deklaracji CIT. Oznacza to, że rozliczenie dochodów strefowych uzyskanych do 31 grudnia 2026 r. pozostaje w pełni bezpieczne i zgodne z obowiązującymi przepisami, nawet jeśli obowiązek podatkowy związany z tym dochodem zostanie zrealizowany w roku następnym.

Podzielamy stanowisko Dyrektora KIS – w naszej ocenie taka wykładnia przepisów jest prawidłowa i znajduje oparcie zarówno w literalnym brzmieniu przepisów, jak i w ich celu. Przedsiębiorcy mogą zatem z pełnym przekonaniem korzystać ze zwolnienia podatkowego w odniesieniu do dochodów uzyskanych w ostatnim roku funkcjonowania SSE, bez ryzyka zakwestionowania prawa do preferencji podatkowej z powodu terminu złożenia deklaracji upływającego w kolejnym roku.

Warto pamiętać, że przedsiębiorcy posiadający zezwolenia na działalność w Specjalnych Strefach Ekonomicznych mogą również uzyskać zwolnienie podatkowe na podstawie decyzji o wsparciu (DoW). Warto już dziś rozważyć realizację nowej inwestycji, aby od 1 stycznia 2027 roku móc korzystać z kolejnego zwolnienia podatkowego. Należy pamiętać, że efektywne korzystanie z nowego zwolnienia na podstawie DoW będzie możliwe dopiero po zakończeniu inwestycji, dlatego tym bardziej warto w końcówce 2025 roku przeanalizować planowane inwestycje i ocenić, czy wartość planowanego CAPEX będzie wystarczająca do uzyskania kolejnego zwolnienia. Rok 2026 może być kluczowy na realizację inwestycji, które pozwolą na dalsze korzystanie z preferencji podatkowych po 2026 r. Zachęcamy do kontaktu z naszym zespołem, który pomoże Państwu w zaplanowaniu kluczowych kroków w tym obszarze.