Sprawa dotyczyła podatnika, który prowadził jednoosobową działalność gospodarczą w zakresie tworzenia programów komputerowych. Podatnik podpisał kontrakt ze spółką kapitałową, w ramach którego zobowiązał się m.in. do usprawnienia istniejących algorytmów, zaprojektowania i zaimplementowania nowych oraz testowania nowych rozwiązań programowych. Wynikiem pracy podatnika był tylko i wyłącznie kod źródłowy programy komputerowego. Spółka zobowiązała się do wypłacenia podatnikowi wynagrodzenia za wszelkie prawa do wytworzonej przez niego własności intelektualnej. Płaca uzależniona była od czasu, jaki podatnik poświęcił na współpracę ze spółką. Oprogramowanie zostało wytworzone przez podatnika w ramach działalności badawczo-rozwojowej. Następnie – zgodnie z umową – podatnik przeniósł prawa do wykonanych utworów na spółkę.
Na tym tle podatnik zwrócił się z wnioskiem o interpretację, w którym zapytał, czy może skorzystać z preferencyjnego opodatkowania dochodów generowanych przez prawa własności intelektualnej IP BOX według sławki 5%, w szczególności dla części ewidencjonowanych czynności, które stanowią działalność badawczo-rozwojową spełniającą definicję zawartą w art. 5a pkt 38 ustawy o PIT.