Sprawa dotyczyła spółki kapitałowej, która prowadziła działalność gospodarczą w zakresie produkcji szyb do samochodów osobowych oraz ciężarowych. Spółka prowadziła działalność za pośrednictwem dwóch zakładów produkcyjnych, z których jeden położony był na terenie Specjalnej Strefy Ekonomicznej. Z uwagi na indywidualne zapotrzebowanie klientów, spółka każdorazowo tworzyła nowy produkt, realizując w ten sposób działalność badawczo-rozwojową. Usługi były świadczone przez spółkę na rzecz podmiotów powiązanych kapitałowo ze spółką na podstawie zawartej umowy. Z tytułu wykonanej usługi spółka otrzymywała wynagrodzenie, które było ustalane zgodnie z tzw. metodą koszt plus marża. Bazę kosztową spółki stanowiły całkowite koszty operacyjne poniesione w danym okresie rozliczeniowym przez spółkę w związku ze świadczeniem usług B+R. Z kolei część kosztów operacyjnych stanowiło koszt podatkowy spółki, w związku z czym spółka otrzymywała wynagrodzenie powiększone o rynkowy narzut zysku. Spółka korzystała z ulgi na działalność badawczo-rozwojową.
Na tym tle spółka zwróciła się z wnioskiem o interpretację, w którym zapytała, czy przysługuje jej prawo do dokonania odliczenia, o którym mowa w art. 18d ustawy o CIT, w przypadku uzyskiwania wynagrodzenia z tytułu świadczenia usług B+R, kalkulowanego na podstawie tzw. metody koszt plus marża.
