W ostatnim czasie w trakcie kontroli podatkowych i celno skarbowych coraz częściej można spotkać się z prośbami władz skarbowych o jednolite pliki kontrolne. Szczególnym zainteresowaniem kontrolujących cieszą się dwa z nich:
Organy po ich otrzymaniu dążą do zestawienia i wzajemnego zweryfikowania danych zawartych w tych dokumentach. W szczególności próbują ustalić czy każda z faktur zawartych w JPK fakturowym została faktycznie ujęta w JPK księgi rachunkowe.
